La guerre de Sécession touche à sa fin. Le major Dundee, commandant d'un fort où sont internés des prisonniers sudistes, décide de poursuivre et exterminer une bande d'Apaches impitoyable qui sème la terreur et la mort au Nouveau-Mexique. N'ayant pas assez d'hommes, il doit enrôler tous les volontaires qui se présentent, y compris les Sudistes. Ceux-ci sont sous les ordres d'un certain Benjamin Tyreen, qui hait cordialement Dundee. Pourtant, il accepte de coopérer avec lui pour éliminer les Apaches, jurant de tuer le major une fois la mission accomplie.